MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p1BJAB0868

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021730	ACT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
2	NC_021730	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
3	NC_021730	CAT	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
4	NC_021730	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529004
5	NC_021730	AAT	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529004
6	NC_021730	A	7	7	1567	1573	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
7	NC_021730	A	6	6	1606	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
8	NC_021730	GTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529005
9	NC_021730	TG	3	6	1667	1672	0 %	50 %	50 %	0 %	523529005
10	NC_021730	A	7	7	1675	1681	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
11	NC_021730	TTGGA	2	10	1701	1710	20 %	40 %	40 %	0 %	523529005
12	NC_021730	A	6	6	1755	1760	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
13	NC_021730	TATT	2	8	1762	1769	25 %	75 %	0 %	0 %	523529005
14	NC_021730	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	523529005
15	NC_021730	T	6	6	1799	1804	0 %	100 %	0 %	0 %	523529005
16	NC_021730	A	6	6	1938	1943	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
17	NC_021730	TAGA	2	8	1980	1987	50 %	25 %	25 %	0 %	523529006
18	NC_021730	T	7	7	2050	2056	0 %	100 %	0 %	0 %	523529006
19	NC_021730	A	6	6	2124	2129	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
20	NC_021730	AGCGA	2	10	2138	2147	40 %	0 %	40 %	20 %	523529006
21	NC_021730	T	8	8	2166	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	523529006
22	NC_021730	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	523529006
23	NC_021730	AGCGAA	2	12	2217	2228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	523529006
24	NC_021730	AGCGA	2	10	2244	2253	40 %	0 %	40 %	20 %	523529006
25	NC_021730	GA	3	6	2489	2494	50 %	0 %	50 %	0 %	523529007
26	NC_021730	ACTTAG	2	12	2536	2547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523529007
27	NC_021730	AAC	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529007
28	NC_021730	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523529007
29	NC_021730	ATCA	2	8	2646	2653	50 %	25 %	0 %	25 %	523529007
30	NC_021730	CG	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	523529007
31	NC_021730	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	523529007
32	NC_021730	CTG	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529007
33	NC_021730	GAA	2	6	2865	2870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529007
34	NC_021730	TAG	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529007
35	NC_021730	TAG	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529007
36	NC_021730	AGAA	2	8	2997	3004	75 %	0 %	25 %	0 %	523529007
37	NC_021730	AAAT	2	8	3079	3086	75 %	25 %	0 %	0 %	523529007
38	NC_021730	AGA	3	9	3166	3174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529007
39	NC_021730	T	6	6	3217	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	523529007
40	NC_021730	A	7	7	3386	3392	100 %	0 %	0 %	0 %	523529007
41	NC_021730	A	6	6	3460	3465	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
42	NC_021730	A	6	6	3590	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
43	NC_021730	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529008
44	NC_021730	AAG	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529008
45	NC_021730	TGA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529008
46	NC_021730	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
47	NC_021730	A	6	6	3664	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
48	NC_021730	GAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529008
49	NC_021730	CAA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
50	NC_021730	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523529008
51	NC_021730	CAC	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523529008
52	NC_021730	ACA	2	6	3808	3813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
53	NC_021730	CAA	2	6	3814	3819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529008
54	NC_021730	AAT	2	6	3838	3843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529008
55	NC_021730	CACAA	2	10	3944	3953	60 %	0 %	0 %	40 %	523529008
56	NC_021730	A	6	6	3952	3957	100 %	0 %	0 %	0 %	523529008
57	NC_021730	CCA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523529009
58	NC_021730	TTA	2	6	4457	4462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529009
59	NC_021730	TATTAA	2	12	4500	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	523529009
60	NC_021730	TA	3	6	4536	4541	50 %	50 %	0 %	0 %	523529009
61	NC_021730	TCA	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529009
62	NC_021730	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529009
63	NC_021730	CTG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529009
64	NC_021730	TAA	2	6	4834	4839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529009
65	NC_021730	A	6	6	4848	4853	100 %	0 %	0 %	0 %	523529009
66	NC_021730	T	6	6	5242	5247	0 %	100 %	0 %	0 %	523529010
67	NC_021730	AGAC	2	8	5364	5371	50 %	0 %	25 %	25 %	523529010
68	NC_021730	GAA	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529010
69	NC_021730	TGG	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529010
70	NC_021730	TGA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529010
71	NC_021730	ATC	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529010
72	NC_021730	GCAAG	2	10	5488	5497	40 %	0 %	40 %	20 %	523529010
73	NC_021730	CA	3	6	5541	5546	50 %	0 %	0 %	50 %	523529011
74	NC_021730	GCTT	2	8	5595	5602	0 %	50 %	25 %	25 %	523529011
75	NC_021730	TGA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529011
76	NC_021730	CAA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523529011
77	NC_021730	CTTG	2	8	5741	5748	0 %	50 %	25 %	25 %	523529011
78	NC_021730	ATGA	2	8	5783	5790	50 %	25 %	25 %	0 %	523529011
79	NC_021730	ATGCT	2	10	5802	5811	20 %	40 %	20 %	20 %	523529011
80	NC_021730	A	6	6	5821	5826	100 %	0 %	0 %	0 %	523529011
81	NC_021730	TCA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529011
82	NC_021730	TAAA	2	8	5968	5975	75 %	25 %	0 %	0 %	523529012
83	NC_021730	TAC	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
84	NC_021730	TGA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
85	NC_021730	ATTC	2	8	6201	6208	25 %	50 %	0 %	25 %	523529012
86	NC_021730	TAT	2	6	6239	6244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529012
87	NC_021730	AGGA	2	8	6253	6260	50 %	0 %	50 %	0 %	523529012
88	NC_021730	AAT	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
89	NC_021730	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523529012
90	NC_021730	TAC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
91	NC_021730	CAG	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523529012
92	NC_021730	CTC	2	6	6604	6609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523529012
93	NC_021730	AGA	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529012
94	NC_021730	ATA	2	6	6742	6747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
95	NC_021730	ATG	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
96	NC_021730	A	6	6	6866	6871	100 %	0 %	0 %	0 %	523529012
97	NC_021730	TAT	2	6	6882	6887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529012
98	NC_021730	GATG	2	8	6896	6903	25 %	25 %	50 %	0 %	523529012
99	NC_021730	ATTA	2	8	6912	6919	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
100	NC_021730	TCA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
101	NC_021730	TC	3	6	6973	6978	0 %	50 %	0 %	50 %	523529012
102	NC_021730	ATG	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
103	NC_021730	TA	3	6	7080	7085	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
104	NC_021730	ATT	2	6	7087	7092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523529012
105	NC_021730	T	6	6	7128	7133	0 %	100 %	0 %	0 %	523529012
106	NC_021730	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
107	NC_021730	AAG	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529012
108	NC_021730	ACC	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523529012
109	NC_021730	CAG	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523529012
110	NC_021730	ACTTT	2	10	7354	7363	20 %	60 %	0 %	20 %	523529012
111	NC_021730	A	6	6	7417	7422	100 %	0 %	0 %	0 %	523529012
112	NC_021730	TAA	2	6	7448	7453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
113	NC_021730	A	7	7	7474	7480	100 %	0 %	0 %	0 %	523529012
114	NC_021730	TAA	2	6	7481	7486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
115	NC_021730	AAGA	2	8	7618	7625	75 %	0 %	25 %	0 %	523529012
116	NC_021730	CTA	2	6	7669	7674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523529012
117	NC_021730	AAT	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
118	NC_021730	GAT	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
119	NC_021730	TACT	2	8	7775	7782	25 %	50 %	0 %	25 %	523529012
120	NC_021730	TA	4	8	7800	7807	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
121	NC_021730	CTG	2	6	7888	7893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523529012
122	NC_021730	CT	3	6	7952	7957	0 %	50 %	0 %	50 %	523529012
123	NC_021730	CCT	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523529012
124	NC_021730	TGA	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523529012
125	NC_021730	ATA	2	6	8164	8169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
126	NC_021730	CA	3	6	8244	8249	50 %	0 %	0 %	50 %	523529012
127	NC_021730	AAT	2	6	8274	8279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523529012
128	NC_021730	AT	3	6	8321	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	523529012
129	NC_021730	GAA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523529012
130	NC_021730	TTTAG	2	10	8346	8355	20 %	60 %	20 %	0 %	523529012
131	NC_021730	AGATA	2	10	8374	8383	60 %	20 %	20 %	0 %	523529012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.